新規論文：Single-organelle DNA-sequencing of chloroplasts and mitochondria in Arabidopsis thaliana
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植物シロイヌナズナ（Arabidopsis thaliana）のミトコンドリアと葉緑体を、1個ずつ分離してDNAシーケンスする「単一オルガネラゲノム解析」の手法と、その適用結果を報告しました。
当研究室で展開してきたdropletベースのsingle amplified genome (SAG)-gelワークフローを植物オルガネラへ拡張し、温和な分画と遊離DNAの除去、dropletへの封入、multiple displacement amplification (MDA)、蛍光ソーティングからライブラリ調製までのプロトコルを整備しました。
葉組織由来のオルガネラゲノムシーケンスのプロファイルは葉緑体でより均一である一方、ミトコンドリアでは断片化が目立ち、単一オルガネラ間の不均一性を反映することが示されました。
本手法は、オルガネラゲノムの組換え・再編成などの解析に向けた実験基盤となります。現在、オルガネラ解析に適した増幅条件の最適化など、手法改良も継続しています。
Xiang Z, Takahashi K, Zhou C, Takanashi H, Arimura SI, Hosokawa M.
BMC Plant Biol. 2026 Jan 26. doi: 10.1186/s12870-026-08232-3.